Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LoxP28301 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LoxP28301 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LoxP28301 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LoxP28301 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LoxP28301 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LoxP28301 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LoxP28301 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LoxP28301 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LoxP28301 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LoxP28301 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LoxP28301 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms