Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb1P28230 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gjb1P28230 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gjb1P28230 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms