Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2-DMaP28078 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-DMaP28078 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms