Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CebpbP28033 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CebpbP28033 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CebpbP28033 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CebpbP28033 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CebpbP28033 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms