Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CenpbP27790 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CenpbP27790 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CenpbP27790 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms