Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lef1P27782 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lef1P27782 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms