Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd40lgP27548 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms