Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou2f1P25425 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pou2f1P25425 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms