Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gria1P23818 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gria1P23818 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gria1P23818 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gria1P23818 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms