Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja1P23242 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja1P23242 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja1P23242 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gja1P23242 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms