Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp36P22893 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zfp36P22893 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zfp36P22893 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms