Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45bP22339 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gadd45bP22339 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms