Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP20293 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP20293 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP20293 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP20293 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP20293 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP20293 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP20293 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP20293 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP20293 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP20293 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TP20293 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TP20293 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TP20293 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TP20293 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TP20293 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms