Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ms4a1P19437 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ms4a1P19437 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms