Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ifrd1P19182 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ifrd1P19182 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ifrd1P19182 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms