Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnnc1P19123 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnnc1P19123 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnnc1P19123 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnnc1P19123 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms