Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P18530 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P18530 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P18530 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18530 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18530 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18530 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms