Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcl9P18340 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcl9P18340 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms