Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a1P12813 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr4a1P12813 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms