Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fv4P11370 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms