Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tnp1P10856 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms