Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CtsbP10605 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CtsbP10605 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtsbP10605 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsbP10605 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms