Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nid1P10493 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms