Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxb4P10284 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxb4P10284 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms