Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UbbP0CG49 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms