Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pax1P09084 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pax1P09084 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms