Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxa1P09022 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa1P09022 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms