Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa5P09021 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa5P09021 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa5P09021 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms