Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf1P07141 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf1P07141 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf1P07141 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csf1P07141 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csf1P07141 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf1P07141 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf1P07141 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf1P07141 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf1P07141 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csf1P07141 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms