Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa3P02831 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa3P02831 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa3P02831 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms