Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2-K1P01901 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms