Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01796 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01796 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01796 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01796 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01796 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
P01796 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01796 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01796 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01796 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01796 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01796 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01796 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01796 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms