Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01790 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01790 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01790 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01790 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01790 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01790 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01790 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01790 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01790 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01790 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01790 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01790 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01790 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms