Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01659 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01659 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01659 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01659 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01659 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01659 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01659 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01659 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01659 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms