Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Igk-V19-17P01633 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Igk-V19-17P01633 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms