Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna1P01572 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms