Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRAMEF12O95522 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF12O95522 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms