Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BlmO88700 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BlmO88700 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BlmO88700 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BlmO88700 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BlmO88700 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BlmO88700 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BlmO88700 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BlmO88700 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BlmO88700 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BlmO88700 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BlmO88700 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BlmO88700 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BlmO88700 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BlmO88700 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BlmO88700 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BlmO88700 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BlmO88700 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BlmO88700 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BlmO88700 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BlmO88700 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BlmO88700 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BlmO88700 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BlmO88700 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
BlmO88700 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BlmO88700 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BlmO88700 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BlmO88700 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BlmO88700 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BlmO88700 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BlmO88700 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BlmO88700 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BlmO88700 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BlmO88700 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BlmO88700 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BlmO88700 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BlmO88700 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
BlmO88700 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BlmO88700 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BlmO88700 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BlmO88700 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BlmO88700 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BlmO88700 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BlmO88700 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BlmO88700 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms