Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capns1O88456 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capns1O88456 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capns1O88456 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms