Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nptx2O70340 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nptx2O70340 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nptx2O70340 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nptx2O70340 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nptx2O70340 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nptx2O70340 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx2O70340 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nptx2O70340 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx2O70340 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nptx2O70340 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nptx2O70340 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms