Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf5O70191 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf5O70191 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf5O70191 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms