Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sigmar1O55242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sigmar1O55242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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