Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl35aO55142 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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