Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mef2bO55087 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mef2bO55087 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms