Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SlkO54988 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SlkO54988 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SlkO54988 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SlkO54988 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SlkO54988 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SlkO54988 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SlkO54988 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SlkO54988 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SlkO54988 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SlkO54988 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SlkO54988 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SlkO54988 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SlkO54988 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SlkO54988 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SlkO54988 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SlkO54988 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SlkO54988 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SlkO54988 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms