Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfsf12O54907 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf12O54907 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms