Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp10aO54827 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp10aO54827 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Atp10aO54827 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms