Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brs3O54798 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brs3O54798 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brs3O54798 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms