Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cavin1O54724 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Cavin1O54724 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Cavin1O54724 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cavin1O54724 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms