Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab33bO35963 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab33bO35963 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms